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    電話:010-80493132

    郵箱:?BPI@proteomics.org.cn

    技術(shù)服務(wù)

     

    蛋白質(zhì)鑒定
    單蛋白樣品質(zhì)譜鑒定
    復(fù)雜蛋白樣品質(zhì)譜鑒定


    定量蛋白質(zhì)組學(xué)
    雙向電泳
    iTRAQ/TMT

    DIA

    MRM/PRM

     

     

     

    蛋白質(zhì)重組表達(dá)體系

     

    哺乳動(dòng)物細(xì)胞表達(dá)純化

     

    大腸桿菌表達(dá)純化

    基因合成、基因克隆、
    載體構(gòu)建、表
    達(dá)純化

     

    平臺(tái)設(shè)施和能力

     

    抗原分析制備

    抗原分析設(shè)計(jì)
    多肽合成偶聯(lián)
    抗原重組表達(dá)


    抗體制備

    兔/小鼠多克隆抗體制備
    小鼠單克隆抗體制備
    抗體純化
    抗體標(biāo)記

     

    工程化制備單克隆抗體

    兔、鼠、羊駝、鯊魚等

     

    抗體開發(fā)

    修飾位點(diǎn)抗體開發(fā)

    小分子抗體開發(fā)

    細(xì)菌、病毒抗體開發(fā)

    配對(duì)抗體開發(fā)
    ELISA試劑盒開發(fā)

    膠體金試紙條/卡開發(fā)

     

    ELISA檢測(cè)

    細(xì)胞因子、激素...
    疾病特征指標(biāo)

     

    芯片檢測(cè)

    蛋白芯片、抗體芯片...

     

    技術(shù)服務(wù)

    全部分類

    DIA定量蛋白質(zhì)組學(xué)分析

    概要:
    概要:
    詳情
    Ø基于二級(jí)質(zhì)譜信號(hào)的定量蛋白質(zhì)組技術(shù)

    Ø數(shù)據(jù)覆蓋度高,定量重現(xiàn)性好

    Ø不需混樣、開啟個(gè)體化蛋白質(zhì)組學(xué)分析新篇章

    Ø避免實(shí)驗(yàn)操作體系影響,回歸大樣本統(tǒng)計(jì)分析,數(shù)據(jù)更可靠

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

    差異定量方法比較

    TMT/iTRAQ

    DIA

    數(shù)據(jù)采集方式

    DDA

    選擇豐度高的離子碎裂,數(shù)據(jù)采集具有一定隨機(jī)性; 只能根據(jù)母離子/報(bào)告離子定量,無(wú)法提取離子對(duì)定量,隨機(jī)性較大,準(zhǔn)確性、重現(xiàn)性較差。

    DIA

    所有離子完全采集,無(wú)數(shù)據(jù)丟失;重現(xiàn)性好;高通量定量分析。

    優(yōu)勢(shì)

    混合上機(jī),質(zhì)譜分析平行性好。

    樣本數(shù)量較少,相對(duì)定量簡(jiǎn)易。

    方法成熟,參考文獻(xiàn)豐富,成本較低。

    質(zhì)譜操作簡(jiǎn)便不需分組分,樣本處理很少,軟件及數(shù)據(jù)庫(kù)快速發(fā)展提高效率。

    DIA全掃描,蛋白鑒定重現(xiàn)性好,可高通量定量分析更多蛋白。

    個(gè)體化分析,樣本數(shù)增加,統(tǒng)計(jì)學(xué)分析更具意義。

    樣本基因表達(dá)差異影響小(不同部位、不同個(gè)體的樣本,均能分析)。

    局限

    基因表達(dá)情況接近的樣本(不能跨部位),為消除個(gè)體差異帶來(lái)的影響,科研上很多時(shí)候還需要混樣。

    樣品數(shù)受限(≤8標(biāo)、≤10標(biāo));樣本數(shù)量較多時(shí)需設(shè)對(duì)照分多組,定量分析困難。

    DDA掃描,蛋白鑒定重現(xiàn)性較差,獲得的差異定量數(shù)據(jù),必須進(jìn)一步驗(yàn)證。

    采用DIA數(shù)據(jù)采集方式,對(duì)質(zhì)譜儀器平臺(tái)要求高。

    數(shù)據(jù)量大,對(duì)方法及軟件效率要求高。

    若大樣本檢測(cè),檢測(cè)成本相對(duì)提高。

     

     

    相關(guān)文獻(xiàn):

     

    Liu Y, Chen J, Sethi A, et al. Glycoproteomic analysis of prostate cancer tissues by SWATH mass spectrometry discovers N-acylethanolamine acid amidase and protein tyrosine kinase 7 as signatures for tumor aggressiveness[J]. Molecular & Cellular Proteomics, 2014, 13(7): 1753-1768.

     

     

    Liu Y, Buil A, Collins B C, et al. Quantitative variability of 342 plasma proteins in a human twin population[J]. Molecular systems biology, 2015, 11(2): 786.

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